E' difficile fare una classifica... diciamo che tutti e tre i fattori che hai elencato sono fondamentali...
Io direi:
1. contenuti
2. ottimizzazione
3. link (siti e directory)
ma noto sempre più frequentemente che, a parità di condizione, conta molto il PR!!!
Altrimenti Google, durante le danze, che motivo avrebbe di metterlo e toglierlo?