Stai usando un browser molto obsoleto. Puoi incorrere in problemi di visualizzazione di questo e altri siti oltre che in problemi di sicurezza. . Dovresti aggiornarlo oppure usarne uno alternativo, moderno e sicuro.
Si è possibile, se utilizzi ad esempio la classe BufferedWriter basta impostare opportunamente il parametro che stabilisce se il contenuto del file di destinazione deve essere sovrascritto o mantenuto.